Η εφαρμογή νέας ηπιότερης ΚΥΑ και η λήξη ισχύος της προηγούμενης με την οποία επιβλήθηκε το μέτρο της προσωρινής απαγόρευσης της τελετής κάθε είδους στις εκκλησίες εξαιτίας της πανδημίας, οδήγησε το Συμβούλιο της Επικρατείας να καταργήσει τις δίκες που σχετίζονταν με προσφυγές ακύρωσης του εν λόγω μέτρου, που είχαν καταθέσει η Ορθόδοξη Εκκλησιαστική Υπακοή και 44 πολίτες.
Ειδικότερα, οι προσφεύγοντες ζητούσαν να ακυρωθεί η από 16.3.2020 απόφαση των υπουργών Παιδείας και Υγείας με την οποία επιβλήθηκε το μέτρο της προσωρινής απαγόρευσης της τελετής κάθε είδους λειτουργιών και ιεροπραξιών στους θρησκευτικούς χώρους λατρείας από 16.3 έως 30.3.2020 λόγω της πανδημίας.
Το Δ΄ Τμήμα του ΣτΕ κατά πλειοψηφία, με τις αποφάσεις του (1294-1296/2020) κατάργησε τις σχετικές δίκες των προσφευγόντων, με το επιχείρημα ότι έληξε η ισχύς της προσβαλλόμενης κοινής υπουργικής απόφασης και η νεότερη-μεταγενέστερη ΚΥΑ επί του ιδίου θέματος "διαφέρει ουσιωδώς" από αυτή που έληξε η ισχύς της.
Σύμφωνα με το σκεπτικό του δικαστηρίου, η νεότερη κοινή υπουργική απόφαση δεν απαγορεύει την λειτουργία των θρησκευτικών χώρων, αλλά την επιτρέπει υπό όρους, οι οποίοι κυρίως έχουν να κάνουν με τον αριθμό των προσώπων που μπορεί να εισέρχονται στους χώρους λατρείας, κ.λπ.
Ωστόσο, μία δικαστής του ΣτΕ και ένας πάρεδος του ανώτατου ακυρωτικού δικαστηρίου, χωρίς δικαίωμα ψήφου, μειοψήφησαν εκφράζοντας την άποψη, ότι με την νέα κοινή υπουργική απόφαση τα απαγορευτικά μέτρα, έστω ηπιότερου χαρακτήρα, εξακολουθούν να είναι δυσμενή για τους προσφεύγοντες στο ΣτΕ και πρέπει να θεωρηθεί ότι η νέα ΚΥΑ εκδόθηκε σε αντικατάσταση της προηγούμενης, με συνέπεια να μπορεί να συνεχιστεί η δίκη για τους προσφεύγοντες.
